我院内分泌科经过二十多年发展，从中医特色专病门诊，逐步建立病房，于2020年12月成立独立内分泌病区。2024年12月新院搬迁后，增加床位至40张，使用率达到100%以上。内分泌科主任陆新在上海瑞金医院内分泌科系统进修，陈国成主任医师在上海龙华医院进修中医内分泌专业。科室人才现有主任医师2人，副主任医师1人，主治医师3名，住院医师2人。有硕士研究生3人，有5人进行系统的专科进修学习。目前门诊设有1个专家门诊、1个专科门诊，1个代谢门诊，有糖尿病、脂肪肝、减重3个特色中医专病门诊。
特色疗法：（1）中药汤剂，中药茶饮：治疗糖尿病，早期糖尿病肾病，脂肪肝，高尿酸，痛风，高脂血症，动脉斑块，糖尿病肠道神经病变，糖尿病周围神经病变，桥本甲状腺炎，甲亢甲减，甲状腺结节等（2）中医外治法：中药热敷，中药熏洗，穴位贴敷，耳穴埋籽，艾灸雷火灸，耳尖放血，中医走罐拔罐刮痧，以及中医传统运动八段锦、太极拳等改善老年肌少症，锻炼心肺功能，改善高血脂血糖血压等代谢综合征等均取得了良好的疗效，受到了患者的一致好评。
科室配备血糖仪，糖尿病足诊断箱，内脏脂肪测定仪，智能身高体重仪，眼底照相检测仪，动脉硬化检测仪，周围神经检测仪，中药熏蒸仪等用于糖尿病并发症筛查。科室成立专科研究室，有施庆岳等名中医查房及茅汉平等名中医经验师承工作。从2018年开始多次举办省级中医药协会的继续教育项目和南通市级继续教育项目。2021年5月国家标准化代谢性疾病管理中心（MMC中心）正式运行，与上海瑞金医院合作，已收录本地区近2600多名患者进行慢病管理。先后有多篇论文在省级以上，以及核心学术期刊上发表，目前有3项课题立项。